المعالجة الحيوية هي تقنية تستخدم الكائنات الحية، مثل الفطريات والبكتيريا والنباتات بغرض التحسين من جودة البيئة عن طريق إزالة أو تحويل المواد السامة إلى مواد أقل في الضرر، فالفطريات يتم استخدامها في هذه العمليات بسبب قدرتها على تفكيك المركبات العضوية السامة والمعادن الثقيلة، فقد تتراكم المواد الكيميائية السامة في كائن حي بمرور الوقت بسبب تعرضه لكميات صغيرة من هذه المواد في البيئة، لذا تعتبر المواد المفككة بواسطة الفطريات ضرورية لتقليل الكميات السامة التي تصل إلى الكائنات الحية العليا في السلسلة الغذائية، ومن الضروري مراعاة استخدام الموارد البيئية بطريقة تفي بكافة الاحتياجات الحالية دون أن يؤثر ذلك على قدرة الأجيال القادمة على تلبية احتياجاتها.
تعتبر الفطريات أمر ضروري في عمليات المعالجة الحيوية، كونها تساهم بفاعلية في تنظيف المناطق الملوثة، ومن خلال فهم الزيادة الحيوية والتضخم الحيوي يمكن اتخاذ إجراءات وقائية تقلل من التأثيرات السلبية للملوثات على كلًا من البيئة وصحة الكائنات الحية.
